【环球网科技报道 记者 林梦雪】从医生手里的听诊器,到X光检查技术,再到基因检测、宏基因组测序……随着技术的发展,病原诊断的效率和灵敏度逐渐提升。
予果生物科技(北京)有限公司创始人&CEO夏涵在接受采访时表示,“如果把传统针对特定病原的检测看成是‘钓鱼’,那么宏基因组二代测序技术(mNGS)就类似于‘大面积撒网捕捞’。mNGS通过对临床样本中直接提取的DNA和/或RNA进行高通量测序,再经过数据库比对与生物信息学分析,可一次性完成细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种病原体检测,实现感染性疾病的精准诊断。”
今年9月份,予果生物凭借病原微生物高通量基因检测方案从全球84个国家和地区的4018个项目中脱颖而出,荣获HICOOL 2021全球创业大赛一等奖。HICOOL全球创业大赛是以海内外人才创业大赛为主体的综合性国际人才活动,大赛打通并建立了海外人才和本土人才来京创新创业的双流通道,今年共有来自84个不同国家的5077名创业者报名参赛,分布在人工智能/金融科技、医药健康、新一代信息技术、新能源/新材料/节能环保、文化创意、高端装备等六大赛道。同时,HICOOL围绕创业项目“发掘-落地-孵化-融资-转化”的普遍生命周期,自2020年起就着力构建大赛/峰会、产业园、管家、基金、在线平台、商学院“六位一体”创新创业生态平台,在海外创业圈、投资人之间形成了广泛影响力。
将mNGS应用于病原感染诊断,是偶然也是必然
2014年全球病原诊断行业发生了一件划时代的事件,美国UCSF团队使用mNGS,对一位反复发烧患者的体液样本进行基因测序并找到了感染病因,帮医生用最常规的青霉素治愈了这位几乎病危的患者。
“在这件划时代的事件之后,我们团队就在思考既然mNGS用于病原感染诊断的优势相当明显,如何将宏基因组测序方法更好地标准化,最终应用在市场广阔的病原诊断领域”,夏涵说到。2017年夏涵带领团队创立了予果生物,成为国内最早深耕mNGS的企业之一。
据了解,予果生物是国内最早将游离核苷酸(cell-free)宏基因组高通量测序技术(mNGS)转化于临床的的企业。其自主研发的PACEseq超高维度机器学习模型,能实现对表型缺乏特异性、病因不明的患者的鉴别,也可以对不同来源的微生物进行过滤和判断,让病原诊断变得更简单,是当下最具创新的数字化解决方案。
改变病原诊断的未来就是数字化病原诊断
当人工智能、传感技术、云计算与大数据等技术融入医疗行业,病原诊断方式也发生了升级改变,数字化的诊断方式可以快速鉴别出致病病原体,辅助医生和患者快速明确感染病因,并对症进行治疗。
夏涵表示,“我们认为下一代的疾病诊断或者未来的疾病诊断应该是基于数字化,因为我们在原来的模拟信号的时代已经停留太长的时间了。”
夏涵指出,相比于传统诊断模式,数字化诊断最大的差别就是获得的数据量的大小。“宏基因组测序方法不做预先假设,一次检测结果通过与含有2万多种病原的数据库对比就可以获得大量的数据,大量的数据依托先进的算法和AI技术,可以从海量微生物数据中提取并判断病原微生物,进而创造出一种全新的病原诊断模式。”他说到。
近年来,第二代基因测序技术(NGS)引领行业快速发展,并且由于其拥有高通量、低成本、测序时间短等诸多优势,至今NGS在全球测序市场中仍占据主导地位。
夏涵表示,“在实际临床应用中,宏基因组测序检测的大量样本中发现有些病原是常见的,有些病原是罕见的,但是正因为宏基因组测序可检测出这些常规方法无法检出的病原,医生可参考宏基因组测序检测结果并结合临床表现对症下药,精准治疗,使患者早日康复。”
资本涌入mNGS市场 创新为本是初心
随着技术的进步,基因测序市场发展迅速。根据NGS(新一代基因测序)行业峰会数据,我国基因测序产业正步入快车道,2018年全球基因测序市场规模达到102.0亿美元,其中中国基因测序市场规模达到92.0亿元人民币,约占全球市场份额的9%-10%。去年我国基因检测企业在一级市场中所获融资达到193亿元,相比2019年融资量,年增长率达153%。
近年来,基因测序行业的迅速发展,吸引了大量资本和企业的涌入。截止2021年中予果生物已经累计完成5.2亿元融资,是mNGS赛道融资体量最大的公司,投资人囊括北极光创投,龙磐资本、辰德资本、创新工场、LYFE等该领域最知名机构。
夏涵认为,“资本的进入加速了市场的发展,竞争对手的布局也让mNGS领域变得热闹起来。但不管市场是低迷还是热闹,予果会一直坚守‘让病原诊断更简单’这个初心使命,踏踏实实去做创新。”
将初心化为动力,从72小时,到48小时,再到9小时……4年多来,予果生物在病原精准诊断的速度上一再取得突破。从全国各医院送来的检测样本,已经可以实现当天晚上11点前上机测试,让医生第二天一早便能根据检测结果制定治疗方案。
前不久,予果生物发布了全新病原检测产品BloodSeq,检测性能远比市场常见产品更快速、更灵敏、更精准。该产品一经推出,受到了临床医生的一致好评。
“我们希望帮助更多的医生进行快速精准的治疗。”夏涵说到。现在,予果生物自主研发的病原数字化检测方案已经在全国31个省份,150多个中心城市开展业务,累计服务超1000家临床医院、2000个临床科室,累计检测样本量近10万例,样本总数位居全球前列,其中脑脊液检测量位列全球第一,且增长速度非常快。
夏涵称,予果生物今年研发投入大约有7000万,明年还会继续加大投入,预测到2024年之前研发投入占比都不会低于30%。予果生物目前能将生信分析和mNGS有效结合,形成较高的技术和数据壁垒。公司未来一段时间仍会专注于研发,做好产品的升级,推动以测序技术做病原诊断市场的发展。
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